超净工作台在管理上应制定相应的监控规程，其主要内容如下：
1、定期监测净工作台、无菌隔离系统的内表面的微生物学质量及其内部的空气质量（粒子和微生物）要求所用的过滤器应能确保使大于等于0.3um的粒子的截留率达到99.97%以上。层流空气的流速应足以将工作区的粒子带出去。*般说来，在距离过滤器下游15—30cm处的平面上（工作区），理想的层流速度应控制在0.36—0.54m/s之间；
2、过滤器的完好性和层流速率应经过确认，在安装完备后须在使用现场进行完好性（泄漏）检查和过滤效率（性能）测试。以后还须定期进行此类测试（通常每半年至少检查1次）；
3、日常管理*旦发现设备运行不稳，或环境监控结果异常，或微生物检验结果偏差呈上升趋势，均须立即进行完好性检查和性能测试。此类检查非常重要，这样可以有效避免给无菌操作带来的潜在污染风险。无菌作业时，应同时监控操作区空气以及操作台表面的微生物学质量，在实验时，应同时做阴阳性对照试验。
