生物安全柜可以有效提升操作安全性和方便性，有效提升实验人员工作效率。而且搭配上多种灭菌器等配套设施，更保证了日常应用的效果。但是应用这类安全柜需要注意以下几个原则。
移动原则
移动安全柜时，为了避免风路状态受到破坏，需要保持缓慢移动。而且柜内操作的过程中，实验人员也同样尽量保持平缓移动。
物品摆放原则
如果生物安全柜中有较多物品，为了避免出现交叉污染情况，柜内各种物品尽量保持一字掰开，而且也要避免回风中出现再次交叉污染的情况。同时要特别注意好保持正常风路，要避免摆放物品直接堵塞回风格栅。
避免震动原则
因为实验室中难免会使用到震动类型的仪器，这样非常容易导致柜内物品出现颗粒物震动、抖落的情况，这样会导致内部操作的洁净度降低，影响到实验结果，也有可能导致不必要的一些污染。所以其余的一些设备尽量与安全柜有一定距离，不要在一个平台上操作。
柜内移动原则
因为柜内可能会有很多不同样品，如果同时要移动2种物品，那么一定要先将低污染物向高污染物移动的方式进行移动，这样在移动的过程中就可以避免出现大面积污染，而且同样也要保证缓慢移动。
建议还是应该由专业人员操作生物安全柜，应用过程中也有很多细节需要注意。一旦出现大面积污染情况，要及时解决，否则也有可能留下安全隐患。
