生物安全柜用良好的习惯使用，以便为工人提供保护。建议采取以下措施以获得好的保护：如果生物安全柜已关闭，则鼓风机应在开始工作之前至少运行四分钟，以使生物安全柜“吹扫”。吹扫将清除生物安全柜中的所有悬浮颗粒。
应使用70％的乙醇，1：100的家用漂白粉稀释液或其他适当的消毒剂擦拭工作表面，内墙，窗户的内表面以及放置在生物安全柜中的材料。使用漂白剂时，需要用无菌水再次擦拭以去除残留的氯，因为它可能腐蚀不锈钢表面。
开始工作之前，请将材料放在BSC中。这样可以很大程度地减少空气幕破坏的次数。
BSC只能放置立即工作所需的材料和设备。将工作流程安排为“干净到脏”。在开始工作之前，请确保窗扇返回到其原始位置。缓慢地移入和移出手臂，以免打断气幕并危及安全壳。
将手/手臂放入内部后，应将材料处理延迟大约一分钟。所有操作应在距前格栅至少四英寸的工作面上进行。将移液器收集在生物安全柜内，以避免频繁的向内/向外移动。在清除生物安全柜内所有可能被污染的材料之前，请对其进行消毒。
限制房间内的其他活动（靠近生物安全柜的移动，步行的交通，打开/关闭房间的门），因为这也可能破坏生物安全柜的空气屏障。不能过分强调正确维护所有生物安全等级的工作柜。按照严格的协议，由经过培训的人员对BSC进行例行检查和测试，以验证BSC是否正常运行。每年进行一次认证，并且每当生物安全柜移动一次。
